城市生態水景觀存在問題的分析，是針對性構建生態景觀水網的基礎依據，水體惡化、生態污染和水資源枯竭等現實的問題縱橫交錯，成為目前城市生態水景觀發展的絆腳石：

　　（1）河道生態功能逐漸喪失，水資源污染問題突出，與人類對水資源的基本需求形成強烈的矛盾，某些原本水資源豐富的南方城市，也逐漸淪落為污染嚴重的缺水城市。目前，大多數城市的內城河水質呈現繼續惡化的趨勢，生活污水、生產廢水、工業廢水和船舶廢油等不斷排入河道，而水體本身的納污和自凈能力有限，將制約著河道生態功能的正常發揮。

　　（2）城市人口的增長、交通網絡的擴展和商業項目的啟動，大部分河道在城市建設的進程中被填埋，或者被改為暗溝，使得水系被分割，無法滿足景觀的水資源暢通要求。

　　（3）為了滿足防洪、泄洪和排污的需求，河道往往被人工化和渠道化改造，雖然有利于航運、發電和灌溉等實際需求，但水系將和土地等生態環境分離，對河岸植物和水生生物產生極大的負面影響，破壞河流周邊的生態環境，阻礙了地下水系循環、地表水系循環和河道的自凈等功能的實現，使得水資源污染的程度加重。